BioGPS带您快速了解基因表达信息

 

往期我们介绍了一些数据库网站的使用方法,最近有些小伙伴想要了解关于基因表达的数据库,我们就来“盘一盘”它!

 

 

 

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进入BioGPS网站(http://biogps.org/)

可以看到,BioGPS的网站主页界面非常简洁,便于大家操作,我搜索了p53这个基因。

搜索后,我们看到的界面是这样的:

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选择human来源,点击TP53

在当前这栏的Gene Report中,可以看到系统默认的Dataset是GeneAtlas U133A,gcrma。这个数据库的选择可以自己选取,点击右边Change Dataset即可。我们可以看到,有6个数据库和3028个数据文库,可以自行选择。

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在查询界面的主页面有一个可以调节的变焦器Zoom,可以调节基因表达柱状图的高度

在表达谱可以看到是各个不同细胞系中TP53的表达情况,结果表明,TP53在721B淋巴细胞中表达量最高

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此外,BioGPS数据库还可以链接到其他数据库,如NCBI、Ensembl、UniProt、OMIM、HomoloGene等等。

例如:可以直接传送到UniProt数据库,查看p53蛋白相关的信息。

 

若是您对于其他的数据库的使用也很感兴趣
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创建时间:2022-10-28 16:14