NCBI数据库使用 | 蛋白序列同源性比对技巧

上期我们介绍了怎么查找序列信息

这期就给大家简单介绍一下——

序列比对的操作方法


我们以“P53蛋白序列”为例

比对人的P53蛋白序列与猪的P53蛋白序列同源性

 闲话不多说,直接上干货!


打开NCBI官网“https://www.ncbi.nlm.nih.gov/”,“All Databases”选择“Protein”,对话框输入p53 human。



点击P53 [Homo sapiens]进入,ORIGIN信息即是人源p53蛋白的氨基酸序列信息;

若是序列信息太长,复制麻烦,可以直接选择ACCESSION号“BAC16799”(推荐使用);

“All Databases”选择“Protein”,对话框输入p53 pig;

可以选ACCESSION“号NP_998989.3”

点击“BLAST”后,选择Protein BLAST;

选择“Align two or more sequences”,分别输入ACCESSION号“BAC16799”和“NP_998989.3”

最终可得到序列同源性比例即为“Per.Ident”值;



本期关于蛋白序列的比对方法就介绍到这里

后续大家还想了解关于什么数据库的使用

可以给我们留言哦

我们会持续更新!

总有一款适合你~

创建时间:2022-12-23 10:23