NCBI数据库使用 | 蛋白序列同源性比对技巧
上期我们介绍了怎么查找序列信息
这期就给大家简单介绍一下——
序列比对的操作方法
我们以“P53蛋白序列”为例
比对人的P53蛋白序列与猪的P53蛋白序列同源性
闲话不多说，直接上干货！
打开NCBI官网“https://www.ncbi.nlm.nih.gov/”，“All Databases”选择“Protein”，对话框输入p53 human。
点击P53 [Homo sapiens]进入，ORIGIN信息即是人源p53蛋白的氨基酸序列信息；
若是序列信息太长，复制麻烦，可以直接选择ACCESSION号“BAC16799”（推荐使用）；
“All Databases”选择“Protein”，对话框输入p53 pig；
可以选ACCESSION“号NP_998989.3”；
点击“BLAST”后，选择Protein BLAST；
选择“Align two or more sequences”，分别输入ACCESSION号“BAC16799”和“NP_998989.3”；
最终可得到序列同源性比例即为“Per.Ident”值；
本期关于蛋白序列的比对方法就介绍到这里
后续大家还想了解关于什么数据库的使用
可以给我们留言哦
我们会持续更新！
总有一款适合你~
创建时间：2022-12-23 10:23
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