流式数据不好?可能从实验设计就出错啦!细节秘籍:多收events




在细胞染色前进行细致的实验设计和规划至关重要,它能提升数据质量并避免因统计意义不足而重复实验。这几个流式数据的常用参数请熟记于心,您将以此为基础开展流式数据分析!


01

事件(Events)

事件代表流式细胞仪检测到的单个颗粒(如细胞)。高于阈值的电信号才能被记录为事件。

02

分辨率(Resolution)

流式细胞仪在测量时所能达到的最大精度。

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CV值(Coefficient of Variation)

是衡量仪器检测信号稳定性和精密度的重要参数,通常以百分比(%)表示。CV值越小,说明数据的一致性越好,仪器的性能越稳定。CV=标准差(SD)/平均值(Mean)×100%。流式细胞仪FSC和荧光信号的荧光通道全峰宽或半峰宽CV值应不大于2%。

04

细胞频率(Cell frequency)

指的是特定细胞亚群在目标分析群体(通常是一个门内的细胞)中所占的百分比(%)。它是最基本、最直观的流式数据分析结果之一。



接下来,就带您详解,流式数据的常见参数受何影响,又如何表征实验结果的!

1

CV值

在流式细胞术中,CV值通常用于评估:

1)荧光信号的分布宽度(如微球或细胞的荧光强度变异程度);

2)仪器的光学和电子系统稳定性,如激光、PMT、液流系统等;

3)评估样本数据的可靠性:CV值越小,样本数据的变异越少,数据越可靠。在流式细胞术检测淋巴细胞亚群时,高比例细胞群(≥30%)多管检测的CV值应≤8%,低比例细胞群(<30%)多管检测的CV值≤15%。


2

 细胞频率

细胞频率(Cell frequency)是流式实验的关键考量因素,直接影响荧光染料选择和需收集的细胞数量(尤其对罕见细胞群体)。


 01

确保足够数据量

若目标细胞频率低于1%,通常需要染色并采集更多细胞以确保足够数据量。实验前请务必参考相关文献和预实验摸索条件,以全面优化实验方案。

此外,即使初始群体中含有T细胞等常见细胞类型,若采用针对T细胞亚群的精细化设门策略,也需考虑细胞频率降低的影响。虽然获取了10万个细胞,但经过目标细胞识别设门后,最终门内仅剩992个细胞。随着设门复杂度的提升,采集足量细胞对确保目标群体真实性(避免人为假象)至关重要。


 02

荧光染料的影响

细胞频率同样受荧光染料选择的影响:针对低密度抗原(表达量低的抗原)或罕见细胞群体,推荐选用高亮度荧光染料——阴性群体(背景区域)的染色干扰可能掩盖弱信号。在细胞分选实验中,目标群体的频率直接影响实验成败:需准备足量起始样本以获得足够的下游实验细胞。此外,频率越低,分选耗时越长;当分选时间超出合理范围时,需考虑调整纯度要求以平衡效率。


 03

不同物种的影响

以下表格可帮助您确定常见人源、小鼠及大鼠组织中的细胞频率【所列数值均为样本白细胞占比(%),仅供实验参考。实际值可能因样本制备、个体差异及动物品系不同而波动。建议做预实验摸索样本目标细胞表达量。】


人细胞频率-外周血


小鼠细胞频率


大鼠细胞频率




此外,流式数据中的统计参数也一并在此介绍~

3

统计参数

(1) Mean:算术均值,当流式结果为线性正态分布时,Mean更接近MFI,代表流式实验为细胞周期倍体等线性轴的结果。

(2) Geometric Mean:几何平均值,它总是小于或等于算术平均值,当流式结果为对数正态分布时,Geo Mean更接近MFI,代表流式实验为一些普遍蛋白表达类的结果,例如一些在细胞上全部表达的蛋白指标。 

(3) Median:中位数是50% events的相对荧光强度,流式结果是对数,而非正态分布,此时通常推荐选择Median,Median不受数据形态分布的影响,不需要是正态分布,可以减少异常值对整个数据的影响,是流式里面用的比较多的一个统计值。

(4) Mode:使用比较少,Mode往往只是为了统计最高峰,对应流式就是表达最多的细胞所在荧光强度,这种只在很少的情况下才会和MFI重合。

(5) Freq. of Parent:圈门内细胞群的events数目占上一级圈门的百分数。

(6) Freq. of Grandparent:圈门内细胞群的events数目占上级圈门的上级圈门中events中的百分数。

(7) Freq.of Total:此圈门内细胞群events数目占收集的总细胞的比例。

(8) Freq.of _ : 自定义比例计算,此圈门events数内占某一层级群体数目的比例。

(9) rCV (Roubust CV):稳健变异系数,rCV等于rSD除以群的中值,定义为 rCV = rSD / Median。

(10) SD值:标准偏差是对数据集分布的度量。较低的值表明数据点更接近平均值,对平均值的置信度更高,我们一般统计不涉及该参数的计算,而是基于样本数量,在把所有样本数据进行输出的时候自动计算的。

(11) rSD (Roubust SD):rSD与一般的标准差不同,它不易被离群点影响。定义为 rSD = 0.75 ×(Q3-Q1),其中Q1和Q3分别为群的第25百分位数和第75百分位数,计算染色SI指数时会用到。

(12) Percentile:n%以下events的荧光强度,n等于50时,等于Median。

(13) Median Abs Dev:中位绝对偏差是衡量总体方差的可靠指标,来自检测的总体中位数中每个细胞的绝对偏差的中位数。

(14) MADP*:中位绝对偏差百分比,等于100乘以中位绝对偏差除以中位数,是在标准化量表上的帮助理解的方差度量。

(15) Count:圈门或者群体中的events数目。



在我们设计实验时,需要综合考虑实验物种、荧光染料、目标细胞等,这些共同影响着我们收集到的流式数据,如果我们可以收集到足够数量的events,可以避免许多偏差,以提高流式实验结果的可信度和准确度。综上所述,流式数据的精准度与events数据息息相关。

此外,我们还准备了平均荧光强度(MFI)流式数据分析相关答疑,感兴趣的老师添加客服,回复“630”获取资料。流式相关产品与服务需求也可联系我们哦!


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创建时间:2025-07-02 15:43
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